Çalışmamız Fırat Üniversitesi Tıp Fakültesi Etik Kurulu
tarafından onaylandıktan sonra Psikiyatri Ana Bilimdalı
tarafından Diagnostic and Statistical Manual of
Mental Disorders-IV (DSM-IV) kriterlerine göre major
depresyon tanısı konmuş hasta ve tamamen sağlıklı
gönüllü bireylerden oluşan kontrol grubunda çalışılmıştır.
Hasta grubunda 133 kontrol grubunda ise 119 birey
çalışmaya dahil edilmiştir. Buna göre, hasta ve kontrol
grubunu oluşturan bireylerden DNA izolasyonu için
EDTA'lı tüplere 3-4 cc venöz kan alındı. Alınan kanlardan
Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı laboratuvarında
standart metodlarla DNA izolasyonu yapıldı ve kullanılıncaya
kadar -20 ºC'de saklandı. ADE genindeki I/D
polimorfizmi için,
Sense: 5'-CTG GAG ACC ACT CCC ATC CTT TCT-
3'
Antisense: 5'-GAT GTG GCC ATC ACA TTC GTC
AGA T-3'
Primerleri kullanılarak ilgili bölge PCR yöntemi
ile çoğaltıldı. % 2'lik agaroz jelde yürütülen amplikonlar
UV ışık yardımıyla görüntülendi. Buna göre; 490 bç
DNA parçasını içeren PCR ürünü, II genotipi (insersiyon/
insersiyon), 190 bç içeren DNA parçasını PCR
ürünü, DD genotipi (delesyon/delesyon), 490 bç ve 190
bç'ni birlikte içeren PCR ürünü ise ID genotipi (insersiyon/
delesyon) olarak değerlendirildi (Resim 1).
Büyütmek İçin Tıklayın |
Resim 1: ADE gen polimorfizm için agaroz jel görüntüsü: M-
100 bç'lik DNA boyut markırı, Sütun 1-2; I/D, 3-4; DD, 5-6; II
genotipe ait PCR ürünü |
Homozigot D/D genotipi örnekler insersiyona özgü
dizileri tespit edebilen özel primerlerle ikinci bir
PCR analizi yapıldı. İkinci PCR işleminde kullanılan
primer dizisi aşağıdaki gibidir.
Sense: 5' TGG GAC CAC AGC GCC CGC CAC TAC
3',
Antisense: 5' TCG CCA GCC CTC CCA TGC CCA
TAA 3'
PCR ürünleri % 2'lik agaroz jel elektroforezinde
yürütüldükten sonra UV ışık altında görüntülendi. D
alleli için 190 bç, I alleli için 270 bç DNA parçaları
gözlendi.
Sonuçlar Ki-Kare veya Fisher Exact testi ile istatistiksel
analize tabi tutuldu ve 0.05'ten küçük p değerleri
anlamlı olarak değerlendirildi.